@MASTERSTHESIS{ 2025:760422176,
 	title = {Identificação e caracterização molecular da família das expansinas no fruto do Coffea arábica L.},
 	year = {2025},
 	url = "http://bdtd.unoeste.br:8080/jspui/handle/jspui/1755",
 	abstract = "O mecanismo de desenvolvimento dos frutos no cafeeiro é caracterizado por intensa divisão celular, alongamento e relaxamento da parede celular, processos relacionados à ação de determinadas proteínas, incluindo as expansinas. As expansinas (EXPs) representam uma família gênica e classificadas em quatro subfamílias: α-expansina (EXPA), β-expansina (EXPB), expansina-like A (EXLA) e expansina-like B (EXLB). Objetificou-se neste estudo a caracterização e idêntificação das expansinas utilizando as ferramentas de bioinformática e molecular no fruto do cafeeiro nas fases perisperma, endosperma e pericarpo. A caracterização desses genes iniciou-se na coleta de informações contidas nos bancos de dados NCBI (National Center for Biotechnology Information) e Phytozome. Em seguida foram utilizadas as ferramentas: ExPASsy e GRAVY (para as informações físico-químicas); PlantmPLoc (localização subcelular); TAIR (genes ortólogos); GSDS estruturação dos genes (éxon/intros); MapGene2chromosomoe (MG2C- mapeamento físico dos cromossomos); alinhamento das sequências utilizando o programa MEGA 11 (análises filogenéticas); Phyre2 (estruturas 3D das proteínas); MEME (Multiple Em for Motif Elicitation- motifs conservados); PlantCARE (regiões regulatórias dos genes), e TBtools informações do Ka/Ks (não sinônimos e sinônimos) e o teste de colinearidade. Para a expressões dos genes, foram coletados o grão do C. arabica L. em quatro estágios de desenvolvimento (30 DAF, 90 DAF, 120 DAF e 180 DAF) e submetidos a análise de qRT-PCR (PCR de transcrição reversa quantitativa em tempo-real). Foram caracterizados in silico 45 genes de expansinas e suas características apresentaram uma variação de 240-300 aminoácidos (aa), peso molecular 21,18 a 32,27 kDa, o ponto isoelétrico (pI) 4.35 a 9.68, e todas foram localizadas na parede celular. Não obstante, foi observado que as proteínas apresentaram característica hidrofóbicas. A estrutura gênica (éxon/íntrons) variaram de 2/1 a 6/5. A relação filogenética os classificou de acordo com as quatro subfamílias de expansinas, formando cinco grupos. Os genes foram distribuídos de
  
 formar desigual nos 11 cromossomos de C. arabica L.. Os motifs conservados variaram de dois a cinco. Os domínios DPBB e CBM63 foram descritas nas suas estruturas 3D de cada proteína. Na sintenia os genes CaEXPA apresentou maior similaridade com os genomas Oryza sativa e Arabidopsis thaliana e a duplicação de alguns genes mostrou- se positiva na análise de Ka/Ks. O resultado da qRT-PCR mostrou que os genes de CaEXPA1,  CaEXPA2,  CaEXPA4,  CaEXPA6,  CaEXLA10,  e  CaEXLB11,  foram
 expressos durante os quatro períodos de desenvolvimento do fruto. O gene CaEXPA1 apresentou a maior empressão durante a 30 DAF, 90 DAF e 120 DAF, enquanto que o gene CaEXPA4 foi o mais expresso entre os genes avaliados, tendo uma alta expressão em todos os périodos de desenvolvimento do grão do cafeeiro. Essas informações estabelecem bases para pesquisas futuras sobre as características funcionais e mecanismos moleculares dos genes de expansinas em C. arabica L. em estágios diferentes de desenvolvimento do grão do café.",
 	publisher = {Universidade do Oeste Paulista},
 	scholl = {Mestrado em Agronomia},
 	note = {Mestrado em Agronomia}
}